SD YPPSB 3, merupakan sekolah yang berada dalam naungan PT Kaltim Prima Coal (KPC) yang berdomisili di Komplek Griya Prima Lestari, Jl Munthe, Desa Teluk Lingga, Kecamatan Sangatta Utara, Kabupaten Kutai Timur. Sebagaimana Kabupaten Kutai Timur, yang merupakan pemekaran dari Kabupaten Kutai, sekolah ini merupakan bentuk pemekaran dari dua sekolah yang telah berdiri lebih dahulu yakni SD YPPSB 1 dan SD YPPSB 2. Sekolah-sekolah ini berada di bawah koordinasi Yayasan Pendidikan Prima Swarga Bara (YPPSB). SD YPPSB 3 berdiri 13 tahun silam, dan diresmikan oleh Bupati Kutai Timur Awang Faroek Ishak pada tanggal 31 Juli tahun 2007.
Sebagai sekolah yang paling muda di YPPSB, SD YPPSB 3 terus berupaya menempa diri agar dapat berkiprah dengan menorehkan prestasi. Dengan usaha keras, membangun kebersamaan, dan dorongan dari berbagai pihak, serta atas ridho dari Tuhan Yang Maha Kuasa telah banyak prestasi yang diukir oleh SD YPPSB 3
